D-ORB

The Overrepresented RNA Blocks

M.J. Dupont, F. Major
D-ORB: A Web Server to Extract Structural Features of Related But Unaligned RNA Sequences
J. Mol. Biol., 435 (2023)

mir-9/mir-79 microRNA precursor family   (Rfam: RF00237)


Options
Negatives sequences: Random sequences of similar lengths
ORBs positions sequence: Best consensus structure-matching sequence
Motifs: 162,498 motifs on the alphabet ACGURYN
Rfam
D-ORB
Augmented

(U()G)
(Y()G)
(A()U)
(G()A)
(.N.)
(.GU.().NN.)
((U)C)A
C(U(U))
C(U(A))
((A)G)C

100.0
100.0
100.0
95.3
100.0
97.7
97.7
100.0
95.3
100.0

(U()G)
(G()A)
(.GU.().NN.)

% of positive sequence with ORB






Deep neural network:

5-fold cross-validation: 98.5 %
(± 0.484 %)

Decision tree:

5-fold cross-validation: 94.5 %
(± 2.37 %)

D-ORB structure
D-ORB structure decision tree:

5-fold cross-validation: 93.5 %
(± 2.88 %)
of AF155142.1/45725-45784
AF155142.1/45725-45784
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUAUUGGUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(((((((.((.(.(.(.(..(((..)))..).).).).)).))))))).).).)
.........1.........2.........3.........4.........5.........6
123456789012345678901234567890123456789012345678901234567890

abstract shape: ()

Number of sequences
Structure ORBs (out of 43) (%)
1 (U()G)
41 95.3
>AF155142.1/45725-45784
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUAUUGGUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
....(.(..............................................).)....
>BAAE01170633.1/457-398
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUUCUGCUCGUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
....(.(..............................................).)....
>CAAE01015022.1/86446-86507
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGACGUACAAUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
....(.(................................................).)....
>AL954314.8/15829-15770
CUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUUAUAACACUGUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
....(.(..............................................).)....
>AC116051.4/129891-129952
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGGUGUGGAGUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
....(.(................................................).)....
>Z81467.1/13319-13384
AUCUUUGGUGAUUCAGCUUCAAUGAUUGGCUACAGGUUUCUUUCAUAAAGCUAGGUUACCAAAGCU
..........(.(........................................).)..........
>AAAB01008960.1/1144939-1144878
CUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUAUUUUAAACGUCAUAAAGCUAGCAUACCGAAGUU
....(.(................................................).)....
>CAAE01014654.1/3052-3111
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUUUAUGUAAUAUCAUAAAGCUAGAGAACCGAAUGU
....(.(..............................................).)....
>BAAF04029497.1/530-469
GUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUGAUUUACCCAUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
....(.(................................................).)....
>BAAF04047241.1/1745-1804
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUUGGUGUAAUAUCAUAAAGCUAGAGAACCGAAUGU
....(.(..............................................).)....
>AANH01000350.1/78292-78353
GUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUUAAUCAUCCAUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
....(.(................................................).)....
>AAJJ01003219.1/11147-11088
UUCUUUGGUGAUCUAGUUGUAUGAGUGUUUUAUAUAUCAUAAAGCUGGUUCAGCAAAGCA
............(.(..............................).)............
>BX664610.10/157221-157162
CUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUUUAUGUGAUAUCAUAAAGCUAGAGAACCGAAUGU
....(.(..............................................).)....
>AANH01005485.1/10565-10509
GUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUUUUAAUUUCAUAAAGCUAGAGAACCGAAAGU
..(.(.................................................).)
>AAFR03045064.1/82617-82556
CUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUUAUUGAGCUAUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
....(.(................................................).)....
>AC005316.1/63325-63386
CUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGCCACAGAGCCGUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
....(.(................................................).)....
>CR848047.6/7022-7083
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUUAUUCAUUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
....(.(................................................).)....
>AASV01010872.1/688-628
GUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGAUAAAUAACGUCAUAAAGCUAGCUUACCGAAGUU
....(.(...............................................).)....
>AAGE02024640.1/55219-55280
UGCUUUGGCGCUUUAGCUGUAUGAUAGAAUUUAAUAUUUCAUAAAGCUAGAUUACCAAAGCA
..........(.(...................................).)...........
>AAZO01004437.1/24877-24818
UUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGGAUAUUUUGAACUUCAUAAAGCUACAUUACCGAAGGU
....(.(..............................................).)....
>AAQA01000025.1/15457-15396
UACUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUAAGUUACUGGCUUCAUAAAGCUAGGUUACCAAAGCU
..(.(.....................................................).).
>AGKD01013711.1/6608-6669
GUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUUAAAUACCUGUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
....(.(................................................).)....
>AAVX01083387.1/420-360
CUCUUUGGUUUUCUAGCUGUAUGAGUGUGUUAUACCUUCAUAAAGCUAGACAACCGAAUGU
....(.(...............................................).)....
>AAGJ04054934.1/20471-20532
CUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGAUGUCAAUGCAUCAUAAAGCUAGGUUACCAAAGAU
..........(.(....................................).)..........
>AEKZ01008225.1/40713-40773
UUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUAUUAUUCGACAUCAUAAAGCUAGGUUACCGGAGUU
....(.(...............................................).)....
>AAGE02019539.1/116880-116941
CUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGAAUUUAGAACAUCAUAAAGCUAGCAUACCGAAGUU
....(.(................................................).)....
>AAPN01432088.1/257-198
GUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUAUGUGAUGUCAUAAAGCUAGAGAACCGAAUGU
....(.(..............................................).)....
>BAAB01140220.1/33-92
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUAUUACUGACGUCAUAAAGCUAGGUUACCGGAGUU
....(.(..............................................).)....
>AAFR03052350.1/15878-15820
AUCUUUGGUUUCCUAGCUGUGUGAGUGUCUCUGAAUCAUAAAGCUGGAGAACCGAAUGU
....(.(.............................................).)....
>AAJJ01000398.1/19121-19058
UUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUAUUGUUUAAUAACAUCAUAAAGCUAGGUUACCGGAGUU
....(.(..................................................).)....
>AAST01027169.1/135-76
UCUUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGAUAAUAACGUCAUAAAGCUAGCCUACCGAAGUU
...(.(...............................................).)....
>AAVX01065791.1/2124-2183
GUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUUUAUUCACCGUCAUAAAGCUAAAUAACCGAAAGU
....(.(..............................................).)....
>AAZX01012164.1/4457-4517
UUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUUUGGUUGUACAUCAUAAAGCUAGGUUACCGGAGUU
....(.(...............................................).)....
>AANU01176011.1/665-604
CUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGCCACAGAGCCGCUCUCAAGCUAGAUAACCGAAAGU
....(.(................................................).)....
>BAAF04134102.1/794-855
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGCCGUAUUUUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
....(.(................................................).)....
>CU462873.19/8896-8955
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUGCUGGCCGUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
....(.(..............................................).)....
>CU467822.7/141255-141194
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUUUAUCUGCCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
....(.(................................................).)....
>AAZO01004036.1/9217-9278
UUCUUUGGUGAUCUAGCUGUAUGGAUAAUAAUUUUAUUCCAUAAAGCUAUUUUACCGAUGUC
....(.(................................................).)....
>CAAK05014843.1/1888-1946
CUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUUAUGAAAUAUCAUAAAGCUAGAGAACCGAAAGU
....(.(.............................................).)....
>AAKO01001629.1/14298-14360
UGCUUUGGCGCUUUAGCUGUAUGAUAGAUUUAAACUACUUCAUAAAGCUAGAUUACCAAAGCA
...........(.(...................................).)...........
>BX465834.20/130413-130472
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUAUUUUGCACUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
....(.(..............................................).)....
2 (U()G)
(Y()G)
37 86.0
>CU467822.7/141255-141194
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUUUAUCUGCCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(................................................).).).)
>BAAF04134102.1/794-855
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGCCGUAUUUUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(................................................).).).)
>AAZO01004437.1/24877-24818
UUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGGAUAUUUUGAACUUCAUAAAGCUACAUUACCGAAGGU
(.(.(.(..............................................).).).)
>AAZX01012164.1/4457-4517
UUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUUUGGUUGUACAUCAUAAAGCUAGGUUACCGGAGUU
.(.((.(...............................................).)).).
>AAST01027169.1/135-76
UCUUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGAUAAUAACGUCAUAAAGCUAGCCUACCGAAGUU
(.(.(.(..............................................).)).).
>BX664610.10/157221-157162
CUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUUUAUGUGAUAUCAUAAAGCUAGAGAACCGAAUGU
(.(.(.(..............................................).).).)
>BAAB01140220.1/33-92
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUAUUACUGACGUCAUAAAGCUAGGUUACCGGAGUU
(.(.(.(..............................................).)).).
>BAAF04029497.1/530-469
GUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUGAUUUACCCAUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(................................................).).).)
>AEKZ01008225.1/40713-40773
UUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUAUUAUUCGACAUCAUAAAGCUAGGUUACCGGAGUU
.(.((.(...............................................).)).).
>AAZO01004036.1/9217-9278
UUCUUUGGUGAUCUAGCUGUAUGGAUAAUAAUUUUAUUCCAUAAAGCUAUUUUACCGAUGUC
.(.((.(................................................).)).).
>AANH01005485.1/10565-10509
GUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUUUUAAUUUCAUAAAGCUAGAGAACCGAAAGU
(.(.(.(...........................................).).).)
>AC116051.4/129891-129952
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGGUGUGGAGUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(................................................).).).)
>AGKD01013711.1/6608-6669
GUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUUAAAUACCUGUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(................................................).).).)
>Z81467.1/13319-13384
AUCUUUGGUGAUUCAGCUUCAAUGAUUGGCUACAGGUUUCUUUCAUAAAGCUAGGUUACCAAAGCU
.(.(......(.(........................................).)......).).
>AF155142.1/45725-45784
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUAUUGGUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(..............................................).).).)
>AAGJ04054934.1/20471-20532
CUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGAUGUCAAUGCAUCAUAAAGCUAGGUUACCAAAGAU
.(.(......(.(....................................).)......).).
>AAVX01083387.1/420-360
CUCUUUGGUUUUCUAGCUGUAUGAGUGUGUUAUACCUUCAUAAAGCUAGACAACCGAAUGU
(.(.(.(...............................................).).).)
>CAAE01014654.1/3052-3111
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUUUAUGUAAUAUCAUAAAGCUAGAGAACCGAAUGU
(.(.(.(..............................................).).).)
>BX465834.20/130413-130472
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUAUUUUGCACUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(..............................................).).).)
>CAAK05014843.1/1888-1946
CUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUUAUGAAAUAUCAUAAAGCUAGAGAACCGAAAGU
(.(.(.(.............................................).).).)
>AAFR03052350.1/15878-15820
AUCUUUGGUUUCCUAGCUGUGUGAGUGUCUCUGAAUCAUAAAGCUGGAGAACCGAAUGU
(.(.(.(.............................................).).).)
>AASV01010872.1/688-628
GUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGAUAAAUAACGUCAUAAAGCUAGCUUACCGAAGUU
(.(.(.(...............................................).)).).
>AAQA01000025.1/15457-15396
UACUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUAAGUUACUGGCUUCAUAAAGCUAGGUUACCAAAGCU
..(.(.....(.(....................................).)......).).
>CAAE01015022.1/86446-86507
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGACGUACAAUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(................................................).).).)
>BAAE01170633.1/457-398
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUUCUGCUCGUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(..............................................).).).)
>AANH01000350.1/78292-78353
GUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUUAAUCAUCCAUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(................................................).).).)
>BAAF04047241.1/1745-1804
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUUGGUGUAAUAUCAUAAAGCUAGAGAACCGAAUGU
(.(.(.(..............................................).).).)
>AC005316.1/63325-63386
CUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGCCACAGAGCCGUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(................................................).).).)
>CU462873.19/8896-8955
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUGCUGGCCGUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(..............................................).).).)
>AAPN01432088.1/257-198
GUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUAUGUGAUGUCAUAAAGCUAGAGAACCGAAUGU
(.(.(.(..............................................).).).)
>AL954314.8/15829-15770
CUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUUAUAACACUGUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(..............................................).).).)
>AAFR03045064.1/82617-82556
CUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUUAUUGAGCUAUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(................................................).).).)
>AAGE02019539.1/116880-116941
CUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGAAUUUAGAACAUCAUAAAGCUAGCAUACCGAAGUU
.(.((.(................................................).)).).
>AAJJ01000398.1/19121-19058
UUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUAUUGUUUAAUAACAUCAUAAAGCUAGGUUACCGGAGUU
.(.((.(..................................................).)).).
>AAAB01008960.1/1144939-1144878
CUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUAUUUUAAACGUCAUAAAGCUAGCAUACCGAAGUU
(.(.(.(................................................).)).).
>AAVX01065791.1/2124-2183
GUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUUUAUUCACCGUCAUAAAGCUAAAUAACCGAAAGU
(.(.(.(..............................................).).).)
>CR848047.6/7022-7083
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUUAUUCAUUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(................................................).).).)
3 (U()G)
(Y()G)
(A()U)
33 76.7
>CU467822.7/141255-141194
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUUUAUCUGCCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(............(.(..................).)............).).).)
>AAST01027169.1/135-76
UCUUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGAUAAUAACGUCAUAAAGCUAGCCUACCGAAGUU
(.(.(.(............(.(................).)............).)).).
>BAAB01140220.1/33-92
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUAUUACUGACGUCAUAAAGCUAGGUUACCGGAGUU
(.(.(.(............(.(................).)............).)).).
>AEKZ01008225.1/40713-40773
UUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUAUUAUUCGACAUCAUAAAGCUAGGUUACCGGAGUU
.(.((.(............(.(.................).)............).)).).
>AGKD01013711.1/6608-6669
GUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUUAAAUACCUGUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(............(.(..................).)............).).).)
>AC116051.4/129891-129952
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGGUGUGGAGUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(............(.(..................).)............).).).)
>AANH01005485.1/10565-10509
GUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUUUUAAUUUCAUAAAGCUAGAGAACCGAAAGU
(.(.(.(............(.(.............).)............).).).)
>AAZO01004036.1/9217-9278
UUCUUUGGUGAUCUAGCUGUAUGGAUAAUAAUUUUAUUCCAUAAAGCUAUUUUACCGAUGUC
.(.((.(............(.(..................).)............).)).).
>AF155142.1/45725-45784
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUAUUGGUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(............(.(................).)............).).).)
>BX465834.20/130413-130472
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUAUUUUGCACUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(............(.(................).)............).).).)
>BAAF04047241.1/1745-1804
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUUGGUGUAAUAUCAUAAAGCUAGAGAACCGAAUGU
(.(.(.(............(.(................).)............).).).)
>AAVX01083387.1/420-360
CUCUUUGGUUUUCUAGCUGUAUGAGUGUGUUAUACCUUCAUAAAGCUAGACAACCGAAUGU
(.(.(.(............(.(.................).)............).).).)
>AL954314.8/15829-15770
CUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUUAUAACACUGUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(............(.(................).)............).).).)
>CAAE01014654.1/3052-3111
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUUUAUGUAAUAUCAUAAAGCUAGAGAACCGAAUGU
(.(.(.(............(.(................).)............).).).)
>BAAF04134102.1/794-855
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGCCGUAUUUUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(............(.(..................).)............).).).)
>AC005316.1/63325-63386
CUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGCCACAGAGCCGUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(............(.(..................).)............).).).)
>AAPN01432088.1/257-198
GUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUAUGUGAUGUCAUAAAGCUAGAGAACCGAAUGU
(.(.(.(............(.(................).)............).).).)
>AANH01000350.1/78292-78353
GUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUUAAUCAUCCAUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(............(.(..................).)............).).).)
>BAAF04029497.1/530-469
GUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUGAUUUACCCAUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(............(.(..................).)............).).).)
>CAAK05014843.1/1888-1946
CUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUUAUGAAAUAUCAUAAAGCUAGAGAACCGAAAGU
(.(.(.(............(.(...............).)............).).).)
>AAAB01008960.1/1144939-1144878
CUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUAUUUUAAACGUCAUAAAGCUAGCAUACCGAAGUU
(.(.(.(............(.(..................).)............).)).).
>BAAE01170633.1/457-398
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUUCUGCUCGUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(............(.(................).)............).).).)
>AASV01010872.1/688-628
GUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGAUAAAUAACGUCAUAAAGCUAGCUUACCGAAGUU
(.(.(.(............(.(.................).)............).)).).
>AAFR03045064.1/82617-82556
CUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUUAUUGAGCUAUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(............(.(..................).)............).).).)
>CU462873.19/8896-8955
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUGCUGGCCGUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(............(.(................).)............).).).)
>CAAE01015022.1/86446-86507
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGACGUACAAUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(............(.(..................).)............).).).)
>AAJJ01000398.1/19121-19058
UUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUAUUGUUUAAUAACAUCAUAAAGCUAGGUUACCGGAGUU
.(.((.(............(.(....................).)............).)).).
>AAGE02019539.1/116880-116941
CUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGAAUUUAGAACAUCAUAAAGCUAGCAUACCGAAGUU
.(.((.(............(.(..................).)............).)).).
>AAVX01065791.1/2124-2183
GUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUUUAUUCACCGUCAUAAAGCUAAAUAACCGAAAGU
(.(.(.(............(.(................).)............).).).)
>CR848047.6/7022-7083
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUUAUUCAUUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(............(.(..................).)............).).).)
>AAZO01004437.1/24877-24818
UUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGGAUAUUUUGAACUUCAUAAAGCUACAUUACCGAAGGU
(.(.(.(............(.(................).)............).).).)
>BX664610.10/157221-157162
CUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUUUAUGUGAUAUCAUAAAGCUAGAGAACCGAAUGU
(.(.(.(............(.(................).)............).).).)
>AAZX01012164.1/4457-4517
UUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUUUGGUUGUACAUCAUAAAGCUAGGUUACCGGAGUU
.(.((.(............(.(.................).)............).)).).
4 (U()G)
(Y()G)
(A()U)
(G()A)
27 62.8
>BAAB01140220.1/33-92
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUAUUACUGACGUCAUAAAGCUAGGUUACCGGAGUU
(.(.(.(..........(.(.(................).).)..........).)).).
>AAST01027169.1/135-76
UCUUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGAUAAUAACGUCAUAAAGCUAGCCUACCGAAGUU
(.(.(.(..........(.(.(................).).)..........).)).).
>AANH01000350.1/78292-78353
GUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUUAAUCAUCCAUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(..........(.(.(..................).).)..........).).).)
>CU467822.7/141255-141194
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUUUAUCUGCCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(..........(.(.(..................).).)..........).).).)
>AF155142.1/45725-45784
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUAUUGGUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(..........(.(.(................).).)..........).).).)
>AL954314.8/15829-15770
CUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUUAUAACACUGUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(..........(.(.(................).).)..........).).).)
>BAAF04047241.1/1745-1804
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUUGGUGUAAUAUCAUAAAGCUAGAGAACCGAAUGU
(.(.(.(..........(.(.(................).).)..........).).).)
>AAVX01083387.1/420-360
CUCUUUGGUUUUCUAGCUGUAUGAGUGUGUUAUACCUUCAUAAAGCUAGACAACCGAAUGU
(.(.(.(..........(.(.(.................).).)..........).).).)
>CAAE01014654.1/3052-3111
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUUUAUGUAAUAUCAUAAAGCUAGAGAACCGAAUGU
(.(.(.(..........(.(.(................).).)..........).).).)
>BAAF04029497.1/530-469
GUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUGAUUUACCCAUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(..........(.(.(..................).).)..........).).).)
>BAAF04134102.1/794-855
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGCCGUAUUUUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(..........(.(.(..................).).)..........).).).)
>AC005316.1/63325-63386
CUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGCCACAGAGCCGUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(..........(.(.(..................).).)..........).).).)
>BAAE01170633.1/457-398
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUUCUGCUCGUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(..........(.(.(................).).)..........).).).)
>AAAB01008960.1/1144939-1144878
CUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUAUUUUAAACGUCAUAAAGCUAGCAUACCGAAGUU
(.(.(.(..........(.(.(..................).).)..........).)).).
>AGKD01013711.1/6608-6669
GUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUUAAAUACCUGUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(..........(.(.(..................).).)..........).).).)
>CAAK05014843.1/1888-1946
CUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUUAUGAAAUAUCAUAAAGCUAGAGAACCGAAAGU
(.(.(.(..........(.(.(...............).).)..........).).).)
>AAFR03045064.1/82617-82556
CUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUUAUUGAGCUAUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(..........(.(.(..................).).)..........).).).)
>AASV01010872.1/688-628
GUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGAUAAAUAACGUCAUAAAGCUAGCUUACCGAAGUU
(.(.(.(..........(.(.(.................).).)..........).)).).
>CU462873.19/8896-8955
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUGCUGGCCGUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(..........(.(.(................).).)..........).).).)
>CAAE01015022.1/86446-86507
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGACGUACAAUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(..........(.(.(..................).).)..........).).).)
>AAVX01065791.1/2124-2183
GUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUUUAUUCACCGUCAUAAAGCUAAAUAACCGAAAGU
(.(.(.(..........(.(.(................).).)..........).).).)
>AC116051.4/129891-129952
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGGUGUGGAGUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(..........(.(.(..................).).)..........).).).)
>BX664610.10/157221-157162
CUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUUUAUGUGAUAUCAUAAAGCUAGAGAACCGAAUGU
(.(.(.(..........(.(.(................).).)..........).).).)
>CR848047.6/7022-7083
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUUAUUCAUUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(..........(.(.(..................).).)..........).).).)
>AAPN01432088.1/257-198
GUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUAUGUGAUGUCAUAAAGCUAGAGAACCGAAUGU
(.(.(.(..........(.(.(................).).)..........).).).)
>AAZO01004437.1/24877-24818
UUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGGAUAUUUUGAACUUCAUAAAGCUACAUUACCGAAGGU
(.(.(.(..........(.(.(................).).)..........).).).)
>BX465834.20/130413-130472
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUAUUUUGCACUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(..........(.(.(................).).)..........).).).)
5 (U()G)
(Y()G)
(A()U)
(G()A)
(.N.)
22 51.2
>AANH01000350.1/78292-78353
GUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUUAAUCAUCCAUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(..........(.(.(......(....)......).).)..........).).).)
>AAVX01083387.1/420-360
CUCUUUGGUUUUCUAGCUGUAUGAGUGUGUUAUACCUUCAUAAAGCUAGACAACCGAAUGU
(.(.(.(..........(.(.(......(...)......).).)..........).).).)
>BX465834.20/130413-130472
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUAUUUUGCACUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(..........(.(.(......(..)......).).)..........).).).)
>CAAE01015022.1/86446-86507
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGACGUACAAUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(..........(.(.(......(....)......).).)..........).).).)
>CU462873.19/8896-8955
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUGCUGGCCGUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(..........(.(.(......(..)......).).)..........).).).)
>AGKD01013711.1/6608-6669
GUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUUAAAUACCUGUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(..........(.(.(......(....)......).).)..........).).).)
>AL954314.8/15829-15770
CUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUUAUAACACUGUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(..........(.(.(......(..)......).).)..........).).).)
>BAAF04047241.1/1745-1804
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUUGGUGUAAUAUCAUAAAGCUAGAGAACCGAAUGU
(.(.(.(..........(.(.(......(..)......).).)..........).).).)
>AAVX01065791.1/2124-2183
GUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUUUAUUCACCGUCAUAAAGCUAAAUAACCGAAAGU
(.(.(.(..........(.(.(......(..)......).).)..........).).).)
>AAFR03045064.1/82617-82556
CUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUUAUUGAGCUAUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(..........(.(.(......(....)......).).)..........).).).)
>BX664610.10/157221-157162
CUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUUUAUGUGAUAUCAUAAAGCUAGAGAACCGAAUGU
(.(.(.(..........(.(.(......(..)......).).)..........).).).)
>CR848047.6/7022-7083
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUUAUUCAUUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(..........(.(.(......(....)......).).)..........).).).)
>CAAE01014654.1/3052-3111
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUUUAUGUAAUAUCAUAAAGCUAGAGAACCGAAUGU
(.(.(.(..........(.(.(......(..)......).).)..........).).).)
>AAZO01004437.1/24877-24818
UUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGGAUAUUUUGAACUUCAUAAAGCUACAUUACCGAAGGU
(.(.(.(..........(.(.(......(..)......).).)..........).).).)
>AC116051.4/129891-129952
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGGUGUGGAGUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(..........(.(.(......(....)......).).)..........).).).)
>AAPN01432088.1/257-198
GUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUAUGUGAUGUCAUAAAGCUAGAGAACCGAAUGU
(.(.(.(..........(.(.(......(..)......).).)..........).).).)
>AF155142.1/45725-45784
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUAUUGGUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(..........(.(.(......(..)......).).)..........).).).)
>CU467822.7/141255-141194
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUUUAUCUGCCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(..........(.(.(......(....)......).).)..........).).).)
>AC005316.1/63325-63386
CUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGCCACAGAGCCGUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(..........(.(.(......(....)......).).)..........).).).)
>BAAE01170633.1/457-398
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUUCUGCUCGUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(..........(.(.(......(..)......).).)..........).).).)
>BAAF04029497.1/530-469
GUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUGAUUUACCCAUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(..........(.(.(......(....)......).).)..........).).).)
>BAAF04134102.1/794-855
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGCCGUAUUUUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(..........(.(.(......(....)......).).)..........).).).)
6 (U()G)
(Y()G)
(A()U)
(G()A)
(.N.)
(.GU.().NN.)
20 46.5
>AAPN01432088.1/257-198
GUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUAUGUGAUGUCAUAAAGCUAGAGAACCGAAUGU
(.(.(.(..........(.(.(.(..(.(..).)..).).).)..........).).).)
>CAAE01015022.1/86446-86507
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGACGUACAAUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(..........(.(.(.(..(.(....).)..).).).)..........).).).)
>BX465834.20/130413-130472
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUAUUUUGCACUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(..........(.(.(.(..(.(..).)..).).).)..........).).).)
>AGKD01013711.1/6608-6669
GUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUUAAAUACCUGUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(..........(.(.(.(..(.(....).)..).).).)..........).).).)
>BAAF04047241.1/1745-1804
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUUGGUGUAAUAUCAUAAAGCUAGAGAACCGAAUGU
(.(.(.(..........(.(.(.(..(.(..).)..).).).)..........).).).)
>CR848047.6/7022-7083
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUUAUUCAUUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(..........(.(.(.(..(.(....).)..).).).)..........).).).)
>BX664610.10/157221-157162
CUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUUUAUGUGAUAUCAUAAAGCUAGAGAACCGAAUGU
(.(.(.(..........(.(.(.(..(.(..).)..).).).)..........).).).)
>CAAE01014654.1/3052-3111
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUUUAUGUAAUAUCAUAAAGCUAGAGAACCGAAUGU
(.(.(.(..........(.(.(.(..(.(..).)..).).).)..........).).).)
>AAVX01083387.1/420-360
CUCUUUGGUUUUCUAGCUGUAUGAGUGUGUUAUACCUUCAUAAAGCUAGACAACCGAAUGU
(.(.(.(..........(.(.(.(..(.(...).)..).).).)..........).).).)
>AL954314.8/15829-15770
CUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUUAUAACACUGUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(..........(.(.(.(..(.(..).)..).).).)..........).).).)
>CU462873.19/8896-8955
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUGCUGGCCGUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(..........(.(.(.(..(.(..).)..).).).)..........).).).)
>BAAF04134102.1/794-855
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGCCGUAUUUUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(..........(.(.(.(..(.(....).)..).).).)..........).).).)
>AC116051.4/129891-129952
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGGUGUGGAGUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(..........(.(.(.(..(.(....).)..).).).)..........).).).)
>AC005316.1/63325-63386
CUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGCCACAGAGCCGUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(..........(.(.(.(..(.(....).)..).).).)..........).).).)
>CU467822.7/141255-141194
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUUUAUCUGCCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(..........(.(.(.(..(.(....).)..).).).)..........).).).)
>AF155142.1/45725-45784
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUAUUGGUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(..........(.(.(.(..(.(..).)..).).).)..........).).).)
>BAAF04029497.1/530-469
GUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUGAUUUACCCAUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(..........(.(.(.(..(.(....).)..).).).)..........).).).)
>BAAE01170633.1/457-398
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUUCUGCUCGUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(..........(.(.(.(..(.(..).)..).).).)..........).).).)
>AAVX01065791.1/2124-2183
GUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUUUAUUCACCGUCAUAAAGCUAAAUAACCGAAAGU
(.(.(.(..........(.(.(.(..(.(..).)..).).).)..........).).).)
>AANH01000350.1/78292-78353
GUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUUAAUCAUCCAUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(..........(.(.(.(..(.(....).)..).).).)..........).).).)
7 (U()G)
(Y()G)
(A()U)
(G()A)
(.N.)
(.GU.().NN.)
((U)C)A
18 41.9
>AGKD01013711.1/6608-6669
GUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUUAAAUACCUGUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(..........(.(.(.(..(.(....).)..).).).)..........).).).)
>AC116051.4/129891-129952
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGGUGUGGAGUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(..........(.(.(.(..(.(....).)..).).).)..........).).).)
>CR848047.6/7022-7083
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUUAUUCAUUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(..........(.(.(.(..(.(....).)..).).).)..........).).).)
>CU467822.7/141255-141194
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUUUAUCUGCCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(..........(.(.(.(..(.(....).)..).).).)..........).).).)
>AF155142.1/45725-45784
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUAUUGGUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(..........(.(.(.(..(.(..).)..).).).)..........).).).)
>AC005316.1/63325-63386
CUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGCCACAGAGCCGUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(..........(.(.(.(..(.(....).)..).).).)..........).).).)
>CU462873.19/8896-8955
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUGCUGGCCGUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(..........(.(.(.(..(.(..).)..).).).)..........).).).)
>CAAE01014654.1/3052-3111
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUUUAUGUAAUAUCAUAAAGCUAGAGAACCGAAUGU
(.(.(.(..........(.(.(.(..(.(..).)..).).).)..........).).).)
>BAAF04047241.1/1745-1804
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUUGGUGUAAUAUCAUAAAGCUAGAGAACCGAAUGU
(.(.(.(..........(.(.(.(..(.(..).)..).).).)..........).).).)
>BAAE01170633.1/457-398
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUUCUGCUCGUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(..........(.(.(.(..(.(..).)..).).).)..........).).).)
>AAVX01083387.1/420-360
CUCUUUGGUUUUCUAGCUGUAUGAGUGUGUUAUACCUUCAUAAAGCUAGACAACCGAAUGU
(.(.(.(..........(.(.(.(..(.(...).)..).).).)..........).).).)
>AL954314.8/15829-15770
CUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUUAUAACACUGUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(..........(.(.(.(..(.(..).)..).).).)..........).).).)
>BAAF04029497.1/530-469
GUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUGAUUUACCCAUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(..........(.(.(.(..(.(....).)..).).).)..........).).).)
>BX465834.20/130413-130472
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUAUUUUGCACUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(..........(.(.(.(..(.(..).)..).).).)..........).).).)
>CAAE01015022.1/86446-86507
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGACGUACAAUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(..........(.(.(.(..(.(....).)..).).).)..........).).).)
>AAPN01432088.1/257-198
GUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUAUGUGAUGUCAUAAAGCUAGAGAACCGAAUGU
(.(.(.(..........(.(.(.(..(.(..).)..).).).)..........).).).)
>BX664610.10/157221-157162
CUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUUUAUGUGAUAUCAUAAAGCUAGAGAACCGAAUGU
(.(.(.(..........(.(.(.(..(.(..).)..).).).)..........).).).)
>BAAF04134102.1/794-855
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGCCGUAUUUUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(..........(.(.(.(..(.(....).)..).).).)..........).).).)
8 (U()G)
(Y()G)
(A()U)
(G()A)
(.N.)
(.GU.().NN.)
((U)C)A
C(U(U))
18 41.9
>CAAE01015022.1/86446-86507
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGACGUACAAUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(..........(.(.(.(..(.(....).)..).).).)..........).).).)
>AAPN01432088.1/257-198
GUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUAUGUGAUGUCAUAAAGCUAGAGAACCGAAUGU
(.(.(.(..........(.(.(.(..(.(..).)..).).).)..........).).).)
>BX664610.10/157221-157162
CUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUUUAUGUGAUAUCAUAAAGCUAGAGAACCGAAUGU
(.(.(.(..........(.(.(.(..(.(..).)..).).).)..........).).).)
>CU462873.19/8896-8955
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUGCUGGCCGUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(..........(.(.(.(..(.(..).)..).).).)..........).).).)
>BX465834.20/130413-130472
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUAUUUUGCACUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(..........(.(.(.(..(.(..).)..).).).)..........).).).)
>AC005316.1/63325-63386
CUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGCCACAGAGCCGUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(..........(.(.(.(..(.(....).)..).).).)..........).).).)
>CU467822.7/141255-141194
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUUUAUCUGCCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(..........(.(.(.(..(.(....).)..).).).)..........).).).)
>AF155142.1/45725-45784
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUAUUGGUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(..........(.(.(.(..(.(..).)..).).).)..........).).).)
>CR848047.6/7022-7083
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUUAUUCAUUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(..........(.(.(.(..(.(....).)..).).).)..........).).).)
>AL954314.8/15829-15770
CUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUUAUAACACUGUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(..........(.(.(.(..(.(..).)..).).).)..........).).).)
>BAAE01170633.1/457-398
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUUCUGCUCGUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(..........(.(.(.(..(.(..).)..).).).)..........).).).)
>BAAF04029497.1/530-469
GUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUGAUUUACCCAUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(..........(.(.(.(..(.(....).)..).).).)..........).).).)
>BAAF04047241.1/1745-1804
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUUGGUGUAAUAUCAUAAAGCUAGAGAACCGAAUGU
(.(.(.(..........(.(.(.(..(.(..).)..).).).)..........).).).)
>AAVX01083387.1/420-360
CUCUUUGGUUUUCUAGCUGUAUGAGUGUGUUAUACCUUCAUAAAGCUAGACAACCGAAUGU
(.(.(.(..........(.(.(.(..(.(...).)..).).).)..........).).).)
>CAAE01014654.1/3052-3111
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUUUAUGUAAUAUCAUAAAGCUAGAGAACCGAAUGU
(.(.(.(..........(.(.(.(..(.(..).)..).).).)..........).).).)
>AC116051.4/129891-129952
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGGUGUGGAGUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(..........(.(.(.(..(.(....).)..).).).)..........).).).)
>BAAF04134102.1/794-855
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGCCGUAUUUUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(..........(.(.(.(..(.(....).)..).).).)..........).).).)
>AGKD01013711.1/6608-6669
GUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUUAAAUACCUGUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(..........(.(.(.(..(.(....).)..).).).)..........).).).)
9 (U()G)
(Y()G)
(A()U)
(G()A)
(.N.)
(.GU.().NN.)
((U)C)A
C(U(U))
C(U(A))
18 41.9
>AC005316.1/63325-63386
CUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGCCACAGAGCCGUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(.....(.(..(.(.(.(..(.(....).)..).).).)..).).....).).).)
>AL954314.8/15829-15770
CUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUUAUAACACUGUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(.....(.(..(.(.(.(..(.(..).)..).).).)..).).....).).).)
>BAAE01170633.1/457-398
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUUCUGCUCGUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(.....(.(..(.(.(.(..(.(..).)..).).).)..).).....).).).)
>BAAF04029497.1/530-469
GUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUGAUUUACCCAUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(.....(.(..(.(.(.(..(.(....).)..).).).)..).).....).).).)
>BAAF04047241.1/1745-1804
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUUGGUGUAAUAUCAUAAAGCUAGAGAACCGAAUGU
(.(.(.(.....(.(..(.(.(.(..(.(..).)..).).).)..).).....).).).)
>BAAF04134102.1/794-855
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGCCGUAUUUUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(.....(.(..(.(.(.(..(.(....).)..).).).)..).).....).).).)
>CAAE01014654.1/3052-3111
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUUUAUGUAAUAUCAUAAAGCUAGAGAACCGAAUGU
(.(.(.(.....(.(..(.(.(.(..(.(..).)..).).).)..).).....).).).)
>AC116051.4/129891-129952
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGGUGUGGAGUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(.....(.(..(.(.(.(..(.(....).)..).).).)..).).....).).).)
>AGKD01013711.1/6608-6669
GUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUUAAAUACCUGUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(.....(.(..(.(.(.(..(.(....).)..).).).)..).).....).).).)
>AAVX01083387.1/420-360
CUCUUUGGUUUUCUAGCUGUAUGAGUGUGUUAUACCUUCAUAAAGCUAGACAACCGAAUGU
(.(.(.(.....(.(..(.(.(.(..(.(...).)..).).).)..).).....).).).)
>BX465834.20/130413-130472
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUAUUUUGCACUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(.....(.(..(.(.(.(..(.(..).)..).).).)..).).....).).).)
>CAAE01015022.1/86446-86507
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGACGUACAAUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(.....(.(..(.(.(.(..(.(....).)..).).).)..).).....).).).)
>CU462873.19/8896-8955
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUGCUGGCCGUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(.....(.(..(.(.(.(..(.(..).)..).).).)..).).....).).).)
>BX664610.10/157221-157162
CUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUUUAUGUGAUAUCAUAAAGCUAGAGAACCGAAUGU
(.(.(.(.....(.(..(.(.(.(..(.(..).)..).).).)..).).....).).).)
>AF155142.1/45725-45784
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUAUUGGUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(.....(.(..(.(.(.(..(.(..).)..).).).)..).).....).).).)
>CR848047.6/7022-7083
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUUAUUCAUUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(.....(.(..(.(.(.(..(.(....).)..).).).)..).).....).).).)
>CU467822.7/141255-141194
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUUUAUCUGCCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(.....(.(..(.(.(.(..(.(....).)..).).).)..).).....).).).)
>AAPN01432088.1/257-198
GUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUAUGUGAUGUCAUAAAGCUAGAGAACCGAAUGU
(.(.(.(.....(.(..(.(.(.(..(.(..).)..).).).)..).).....).).).)
10 (U()G)
(Y()G)
(A()U)
(G()A)
(.N.)
(.GU.().NN.)
((U)C)A
C(U(U))
C(U(A))
((A)G)C
17 39.5
>AF155142.1/45725-45784
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUAUUGGUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(.....(.((.(.(.(.(..(.(..).)..).).).).)).).....).).).)
>BX664610.10/157221-157162
CUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUUUAUGUGAUAUCAUAAAGCUAGAGAACCGAAUGU
(.(.(.(.....(.((.(.(.(.(..(.(..).)..).).).).)).).....).).).)
>AAPN01432088.1/257-198
GUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUAUGUGAUGUCAUAAAGCUAGAGAACCGAAUGU
(.(.(.(.....(.((.(.(.(.(..(.(..).)..).).).).)).).....).).).)
>BAAF04047241.1/1745-1804
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUUGGUGUAAUAUCAUAAAGCUAGAGAACCGAAUGU
(.(.(.(.....(.((.(.(.(.(..(.(..).)..).).).).)).).....).).).)
>BX465834.20/130413-130472
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUAUUUUGCACUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(.....(.((.(.(.(.(..(.(..).)..).).).).)).).....).).).)
>CU462873.19/8896-8955
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUGCUGGCCGUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(.....(.((.(.(.(.(..(.(..).)..).).).).)).).....).).).)
>AL954314.8/15829-15770
CUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUUAUAACACUGUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(.....(.((.(.(.(.(..(.(..).)..).).).).)).).....).).).)
>AAVX01083387.1/420-360
CUCUUUGGUUUUCUAGCUGUAUGAGUGUGUUAUACCUUCAUAAAGCUAGACAACCGAAUGU
(.(.(.(.....(.((.(.(.(.(..(.(...).)..).).).).)).).....).).).)
>CAAE01014654.1/3052-3111
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUUUAUGUAAUAUCAUAAAGCUAGAGAACCGAAUGU
(.(.(.(.....(.((.(.(.(.(..(.(..).)..).).).).)).).....).).).)
>AC116051.4/129891-129952
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGGUGUGGAGUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(.....(.((.(.(.(.(..(.(....).)..).).).).)).).....).).).)
>AGKD01013711.1/6608-6669
GUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUUAAAUACCUGUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(.....(.((.(.(.(.(..(.(....).)..).).).).)).).....).).).)
>CU467822.7/141255-141194
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUUUAUCUGCCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(.....(.((.(.(.(.(..(.(....).)..).).).).)).).....).).).)
>CR848047.6/7022-7083
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUUAUUCAUUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(.....(.((.(.(.(.(..(.(....).)..).).).).)).).....).).).)
>CAAE01015022.1/86446-86507
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGACGUACAAUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(.....(.((.(.(.(.(..(.(....).)..).).).).)).).....).).).)
>BAAF04029497.1/530-469
GUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUGAUUUACCCAUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(.....(.((.(.(.(.(..(.(....).)..).).).).)).).....).).).)
>BAAE01170633.1/457-398
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUUCUGCUCGUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(.....(.((.(.(.(.(..(.(..).)..).).).).)).).....).).).)
>BAAF04134102.1/794-855
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGCCGUAUUUUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
(.(.(.(.....(.((.(.(.(.(..(.(....).)..).).).).)).).....).).).)

>AF155142.1/45725-45784
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUAUUGGUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
....(.(..............................................).)....
(.(.(.(..............................................).).).)
(.(.(.(............(.(................).)............).).).)
(.(.(.(..........(.(.(................).).)..........).).).)
(.(.(.(..........(.(.(......(..)......).).)..........).).).)
(.(.(.(..........(.(.(.(..(.(..).)..).).).)..........).).).)
(.(.(.(..........(.(.(.(..(.(..).)..).).).)..........).).).)
(.(.(.(..........(.(.(.(..(.(..).)..).).).)..........).).).)
(.(.(.(.....(.(..(.(.(.(..(.(..).)..).).).)..).).....).).).)
(.(.(.(.....(.((.(.(.(.(..(.(..).)..).).).).)).).....).).).)
>BAAE01170633.1/457-398
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUUCUGCUCGUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
....(.(..............................................).)....
(.(.(.(..............................................).).).)
(.(.(.(............(.(................).)............).).).)
(.(.(.(..........(.(.(................).).)..........).).).)
(.(.(.(..........(.(.(......(..)......).).)..........).).).)
(.(.(.(..........(.(.(.(..(.(..).)..).).).)..........).).).)
(.(.(.(..........(.(.(.(..(.(..).)..).).).)..........).).).)
(.(.(.(..........(.(.(.(..(.(..).)..).).).)..........).).).)
(.(.(.(.....(.(..(.(.(.(..(.(..).)..).).).)..).).....).).).)
(.(.(.(.....(.((.(.(.(.(..(.(..).)..).).).).)).).....).).).)
>CAAE01015022.1/86446-86507
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGACGUACAAUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
....(.(................................................).)....
(.(.(.(................................................).).).)
(.(.(.(............(.(..................).)............).).).)
(.(.(.(..........(.(.(..................).).)..........).).).)
(.(.(.(..........(.(.(......(....)......).).)..........).).).)
(.(.(.(..........(.(.(.(..(.(....).)..).).).)..........).).).)
(.(.(.(..........(.(.(.(..(.(....).)..).).).)..........).).).)
(.(.(.(..........(.(.(.(..(.(....).)..).).).)..........).).).)
(.(.(.(.....(.(..(.(.(.(..(.(....).)..).).).)..).).....).).).)
(.(.(.(.....(.((.(.(.(.(..(.(....).)..).).).).)).).....).).).)
>AL954314.8/15829-15770
CUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUUAUAACACUGUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
....(.(..............................................).)....
(.(.(.(..............................................).).).)
(.(.(.(............(.(................).)............).).).)
(.(.(.(..........(.(.(................).).)..........).).).)
(.(.(.(..........(.(.(......(..)......).).)..........).).).)
(.(.(.(..........(.(.(.(..(.(..).)..).).).)..........).).).)
(.(.(.(..........(.(.(.(..(.(..).)..).).).)..........).).).)
(.(.(.(..........(.(.(.(..(.(..).)..).).).)..........).).).)
(.(.(.(.....(.(..(.(.(.(..(.(..).)..).).).)..).).....).).).)
(.(.(.(.....(.((.(.(.(.(..(.(..).)..).).).).)).).....).).).)
>AC116051.4/129891-129952
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGGUGUGGAGUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
....(.(................................................).)....
(.(.(.(................................................).).).)
(.(.(.(............(.(..................).)............).).).)
(.(.(.(..........(.(.(..................).).)..........).).).)
(.(.(.(..........(.(.(......(....)......).).)..........).).).)
(.(.(.(..........(.(.(.(..(.(....).)..).).).)..........).).).)
(.(.(.(..........(.(.(.(..(.(....).)..).).).)..........).).).)
(.(.(.(..........(.(.(.(..(.(....).)..).).).)..........).).).)
(.(.(.(.....(.(..(.(.(.(..(.(....).)..).).).)..).).....).).).)
(.(.(.(.....(.((.(.(.(.(..(.(....).)..).).).).)).).....).).).)
>CAAE01014654.1/3052-3111
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUUUAUGUAAUAUCAUAAAGCUAGAGAACCGAAUGU
....(.(..............................................).)....
(.(.(.(..............................................).).).)
(.(.(.(............(.(................).)............).).).)
(.(.(.(..........(.(.(................).).)..........).).).)
(.(.(.(..........(.(.(......(..)......).).)..........).).).)
(.(.(.(..........(.(.(.(..(.(..).)..).).).)..........).).).)
(.(.(.(..........(.(.(.(..(.(..).)..).).).)..........).).).)
(.(.(.(..........(.(.(.(..(.(..).)..).).).)..........).).).)
(.(.(.(.....(.(..(.(.(.(..(.(..).)..).).).)..).).....).).).)
(.(.(.(.....(.((.(.(.(.(..(.(..).)..).).).).)).).....).).).)
>BAAF04029497.1/530-469
GUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUGAUUUACCCAUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
....(.(................................................).)....
(.(.(.(................................................).).).)
(.(.(.(............(.(..................).)............).).).)
(.(.(.(..........(.(.(..................).).)..........).).).)
(.(.(.(..........(.(.(......(....)......).).)..........).).).)
(.(.(.(..........(.(.(.(..(.(....).)..).).).)..........).).).)
(.(.(.(..........(.(.(.(..(.(....).)..).).).)..........).).).)
(.(.(.(..........(.(.(.(..(.(....).)..).).).)..........).).).)
(.(.(.(.....(.(..(.(.(.(..(.(....).)..).).).)..).).....).).).)
(.(.(.(.....(.((.(.(.(.(..(.(....).)..).).).).)).).....).).).)
>BAAF04047241.1/1745-1804
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUUGGUGUAAUAUCAUAAAGCUAGAGAACCGAAUGU
....(.(..............................................).)....
(.(.(.(..............................................).).).)
(.(.(.(............(.(................).)............).).).)
(.(.(.(..........(.(.(................).).)..........).).).)
(.(.(.(..........(.(.(......(..)......).).)..........).).).)
(.(.(.(..........(.(.(.(..(.(..).)..).).).)..........).).).)
(.(.(.(..........(.(.(.(..(.(..).)..).).).)..........).).).)
(.(.(.(..........(.(.(.(..(.(..).)..).).).)..........).).).)
(.(.(.(.....(.(..(.(.(.(..(.(..).)..).).).)..).).....).).).)
(.(.(.(.....(.((.(.(.(.(..(.(..).)..).).).).)).).....).).).)
>BX664610.10/157221-157162
CUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUUUAUGUGAUAUCAUAAAGCUAGAGAACCGAAUGU
....(.(..............................................).)....
(.(.(.(..............................................).).).)
(.(.(.(............(.(................).)............).).).)
(.(.(.(..........(.(.(................).).)..........).).).)
(.(.(.(..........(.(.(......(..)......).).)..........).).).)
(.(.(.(..........(.(.(.(..(.(..).)..).).).)..........).).).)
(.(.(.(..........(.(.(.(..(.(..).)..).).).)..........).).).)
(.(.(.(..........(.(.(.(..(.(..).)..).).).)..........).).).)
(.(.(.(.....(.(..(.(.(.(..(.(..).)..).).).)..).).....).).).)
(.(.(.(.....(.((.(.(.(.(..(.(..).)..).).).).)).).....).).).)
>CR848047.6/7022-7083
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUUAUUCAUUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
....(.(................................................).)....
(.(.(.(................................................).).).)
(.(.(.(............(.(..................).)............).).).)
(.(.(.(..........(.(.(..................).).)..........).).).)
(.(.(.(..........(.(.(......(....)......).).)..........).).).)
(.(.(.(..........(.(.(.(..(.(....).)..).).).)..........).).).)
(.(.(.(..........(.(.(.(..(.(....).)..).).).)..........).).).)
(.(.(.(..........(.(.(.(..(.(....).)..).).).)..........).).).)
(.(.(.(.....(.(..(.(.(.(..(.(....).)..).).).)..).).....).).).)
(.(.(.(.....(.((.(.(.(.(..(.(....).)..).).).).)).).....).).).)
>AGKD01013711.1/6608-6669
GUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUUAAAUACCUGUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
....(.(................................................).)....
(.(.(.(................................................).).).)
(.(.(.(............(.(..................).)............).).).)
(.(.(.(..........(.(.(..................).).)..........).).).)
(.(.(.(..........(.(.(......(....)......).).)..........).).).)
(.(.(.(..........(.(.(.(..(.(....).)..).).).)..........).).).)
(.(.(.(..........(.(.(.(..(.(....).)..).).).)..........).).).)
(.(.(.(..........(.(.(.(..(.(....).)..).).).)..........).).).)
(.(.(.(.....(.(..(.(.(.(..(.(....).)..).).).)..).).....).).).)
(.(.(.(.....(.((.(.(.(.(..(.(....).)..).).).).)).).....).).).)
>AAVX01083387.1/420-360
CUCUUUGGUUUUCUAGCUGUAUGAGUGUGUUAUACCUUCAUAAAGCUAGACAACCGAAUGU
....(.(...............................................).)....
(.(.(.(...............................................).).).)
(.(.(.(............(.(.................).)............).).).)
(.(.(.(..........(.(.(.................).).)..........).).).)
(.(.(.(..........(.(.(......(...)......).).)..........).).).)
(.(.(.(..........(.(.(.(..(.(...).)..).).).)..........).).).)
(.(.(.(..........(.(.(.(..(.(...).)..).).).)..........).).).)
(.(.(.(..........(.(.(.(..(.(...).)..).).).)..........).).).)
(.(.(.(.....(.(..(.(.(.(..(.(...).)..).).).)..).).....).).).)
(.(.(.(.....(.((.(.(.(.(..(.(...).)..).).).).)).).....).).).)
>AAPN01432088.1/257-198
GUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUAUGUGAUGUCAUAAAGCUAGAGAACCGAAUGU
....(.(..............................................).)....
(.(.(.(..............................................).).).)
(.(.(.(............(.(................).)............).).).)
(.(.(.(..........(.(.(................).).)..........).).).)
(.(.(.(..........(.(.(......(..)......).).)..........).).).)
(.(.(.(..........(.(.(.(..(.(..).)..).).).)..........).).).)
(.(.(.(..........(.(.(.(..(.(..).)..).).).)..........).).).)
(.(.(.(..........(.(.(.(..(.(..).)..).).).)..........).).).)
(.(.(.(.....(.(..(.(.(.(..(.(..).)..).).).)..).).....).).).)
(.(.(.(.....(.((.(.(.(.(..(.(..).)..).).).).)).).....).).).)
>BAAF04134102.1/794-855
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGCCGUAUUUUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
....(.(................................................).)....
(.(.(.(................................................).).).)
(.(.(.(............(.(..................).)............).).).)
(.(.(.(..........(.(.(..................).).)..........).).).)
(.(.(.(..........(.(.(......(....)......).).)..........).).).)
(.(.(.(..........(.(.(.(..(.(....).)..).).).)..........).).).)
(.(.(.(..........(.(.(.(..(.(....).)..).).).)..........).).).)
(.(.(.(..........(.(.(.(..(.(....).)..).).).)..........).).).)
(.(.(.(.....(.(..(.(.(.(..(.(....).)..).).).)..).).....).).).)
(.(.(.(.....(.((.(.(.(.(..(.(....).)..).).).).)).).....).).).)
>CU462873.19/8896-8955
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUGCUGGCCGUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
....(.(..............................................).)....
(.(.(.(..............................................).).).)
(.(.(.(............(.(................).)............).).).)
(.(.(.(..........(.(.(................).).)..........).).).)
(.(.(.(..........(.(.(......(..)......).).)..........).).).)
(.(.(.(..........(.(.(.(..(.(..).)..).).).)..........).).).)
(.(.(.(..........(.(.(.(..(.(..).)..).).).)..........).).).)
(.(.(.(..........(.(.(.(..(.(..).)..).).).)..........).).).)
(.(.(.(.....(.(..(.(.(.(..(.(..).)..).).).)..).).....).).).)
(.(.(.(.....(.((.(.(.(.(..(.(..).)..).).).).)).).....).).).)
>CU467822.7/141255-141194
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUUUAUCUGCCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
....(.(................................................).)....
(.(.(.(................................................).).).)
(.(.(.(............(.(..................).)............).).).)
(.(.(.(..........(.(.(..................).).)..........).).).)
(.(.(.(..........(.(.(......(....)......).).)..........).).).)
(.(.(.(..........(.(.(.(..(.(....).)..).).).)..........).).).)
(.(.(.(..........(.(.(.(..(.(....).)..).).).)..........).).).)
(.(.(.(..........(.(.(.(..(.(....).)..).).).)..........).).).)
(.(.(.(.....(.(..(.(.(.(..(.(....).)..).).).)..).).....).).).)
(.(.(.(.....(.((.(.(.(.(..(.(....).)..).).).).)).).....).).).)
>BX465834.20/130413-130472
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUAUUUUGCACUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
....(.(..............................................).)....
(.(.(.(..............................................).).).)
(.(.(.(............(.(................).)............).).).)
(.(.(.(..........(.(.(................).).)..........).).).)
(.(.(.(..........(.(.(......(..)......).).)..........).).).)
(.(.(.(..........(.(.(.(..(.(..).)..).).).)..........).).).)
(.(.(.(..........(.(.(.(..(.(..).)..).).).)..........).).).)
(.(.(.(..........(.(.(.(..(.(..).)..).).).)..........).).).)
(.(.(.(.....(.(..(.(.(.(..(.(..).)..).).).)..).).....).).).)
(.(.(.(.....(.((.(.(.(.(..(.(..).)..).).).).)).).....).).).)
>AC005316.1/63325-63386
CUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGCCACAGAGCCGUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
....(.(................................................).)....
(.(.(.(................................................).).).)
(.(.(.(............(.(..................).)............).).).)
(.(.(.(..........(.(.(..................).).)..........).).).)
(.(.(.(..........(.(.(......(....)......).).)..........).).).)
(.(.(.(..........(.(.(.(..(.(....).)..).).).)..........).).).)
(.(.(.(..........(.(.(.(..(.(....).)..).).).)..........).).).)
(.(.(.(..........(.(.(.(..(.(....).)..).).).)..........).).).)
(.(.(.(.....(.(..(.(.(.(..(.(....).)..).).).)..).).....).).).)
>AANH01000350.1/78292-78353
GUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUUAAUCAUCCAUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
....(.(................................................).)....
(.(.(.(................................................).).).)
(.(.(.(............(.(..................).)............).).).)
(.(.(.(..........(.(.(..................).).)..........).).).)
(.(.(.(..........(.(.(......(....)......).).)..........).).).)
(.(.(.(..........(.(.(.(..(.(....).)..).).).)..........).).).)
>AAVX01065791.1/2124-2183
GUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUUUAUUCACCGUCAUAAAGCUAAAUAACCGAAAGU
....(.(..............................................).)....
(.(.(.(..............................................).).).)
(.(.(.(............(.(................).)............).).).)
(.(.(.(..........(.(.(................).).)..........).).).)
(.(.(.(..........(.(.(......(..)......).).)..........).).).)
(.(.(.(..........(.(.(.(..(.(..).)..).).).)..........).).).)
>AAFR03045064.1/82617-82556
CUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUUAUUGAGCUAUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
....(.(................................................).)....
(.(.(.(................................................).).).)
(.(.(.(............(.(..................).)............).).).)
(.(.(.(..........(.(.(..................).).)..........).).).)
(.(.(.(..........(.(.(......(....)......).).)..........).).).)
>AAZO01004437.1/24877-24818
UUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGGAUAUUUUGAACUUCAUAAAGCUACAUUACCGAAGGU
....(.(..............................................).)....
(.(.(.(..............................................).).).)
(.(.(.(............(.(................).)............).).).)
(.(.(.(..........(.(.(................).).)..........).).).)
(.(.(.(..........(.(.(......(..)......).).)..........).).).)
>AAAB01008960.1/1144939-1144878
CUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUAUUUUAAACGUCAUAAAGCUAGCAUACCGAAGUU
....(.(................................................).)....
(.(.(.(................................................).)).).
(.(.(.(............(.(..................).)............).)).).
(.(.(.(..........(.(.(..................).).)..........).)).).
>AASV01010872.1/688-628
GUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGAUAAAUAACGUCAUAAAGCUAGCUUACCGAAGUU
....(.(...............................................).)....
(.(.(.(...............................................).)).).
(.(.(.(............(.(.................).)............).)).).
(.(.(.(..........(.(.(.................).).)..........).)).).
>BAAB01140220.1/33-92
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUAUUACUGACGUCAUAAAGCUAGGUUACCGGAGUU
....(.(..............................................).)....
(.(.(.(..............................................).)).).
(.(.(.(............(.(................).)............).)).).
(.(.(.(..........(.(.(................).).)..........).)).).
>AAST01027169.1/135-76
UCUUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGAUAAUAACGUCAUAAAGCUAGCCUACCGAAGUU
...(.(...............................................).)....
(.(.(.(..............................................).)).).
(.(.(.(............(.(................).)............).)).).
(.(.(.(..........(.(.(................).).)..........).)).).
>CAAK05014843.1/1888-1946
CUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUUAUGAAAUAUCAUAAAGCUAGAGAACCGAAAGU
....(.(.............................................).)....
(.(.(.(.............................................).).).)
(.(.(.(............(.(...............).)............).).).)
(.(.(.(..........(.(.(...............).).)..........).).).)
>AANH01005485.1/10565-10509
GUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUUUUAAUUUCAUAAAGCUAGAGAACCGAAAGU
..(.(.................................................).)
(.(.(.(...........................................).).).)
(.(.(.(............(.(.............).)............).).).)
>AEKZ01008225.1/40713-40773
UUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUAUUAUUCGACAUCAUAAAGCUAGGUUACCGGAGUU
....(.(...............................................).)....
.(.((.(...............................................).)).).
.(.((.(............(.(.................).)............).)).).
>AAGE02019539.1/116880-116941
CUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGAAUUUAGAACAUCAUAAAGCUAGCAUACCGAAGUU
....(.(................................................).)....
.(.((.(................................................).)).).
.(.((.(............(.(..................).)............).)).).
>AAJJ01000398.1/19121-19058
UUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUAUUGUUUAAUAACAUCAUAAAGCUAGGUUACCGGAGUU
....(.(..................................................).)....
.(.((.(..................................................).)).).
.(.((.(............(.(....................).)............).)).).
>AAZX01012164.1/4457-4517
UUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUUUGGUUGUACAUCAUAAAGCUAGGUUACCGGAGUU
....(.(...............................................).)....
.(.((.(...............................................).)).).
.(.((.(............(.(.................).)............).)).).
>AAZO01004036.1/9217-9278
UUCUUUGGUGAUCUAGCUGUAUGGAUAAUAAUUUUAUUCCAUAAAGCUAUUUUACCGAUGUC
....(.(................................................).)....
.(.((.(................................................).)).).
.(.((.(............(.(..................).)............).)).).
>Z81467.1/13319-13384
AUCUUUGGUGAUUCAGCUUCAAUGAUUGGCUACAGGUUUCUUUCAUAAAGCUAGGUUACCAAAGCU
..........(.(........................................).)..........
.(.(......(.(........................................).)......).).
>AAQA01000025.1/15457-15396
UACUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUAAGUUACUGGCUUCAUAAAGCUAGGUUACCAAAGCU
..(.(.....................................................).).
..(.(.....(.(....................................).)......).).
>AAGJ04054934.1/20471-20532
CUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGAUGUCAAUGCAUCAUAAAGCUAGGUUACCAAAGAU
..........(.(....................................).)..........
.(.(......(.(....................................).)......).).
>AAFR03052350.1/15878-15820
AUCUUUGGUUUCCUAGCUGUGUGAGUGUCUCUGAAUCAUAAAGCUGGAGAACCGAAUGU
....(.(.............................................).)....
(.(.(.(.............................................).).).)
>AAJJ01003219.1/11147-11088
UUCUUUGGUGAUCUAGUUGUAUGAGUGUUUUAUAUAUCAUAAAGCUGGUUCAGCAAAGCA
............(.(..............................).)............
>AAGE02024640.1/55219-55280
UGCUUUGGCGCUUUAGCUGUAUGAUAGAAUUUAAUAUUUCAUAAAGCUAGAUUACCAAAGCA
..........(.(...................................).)...........
>AANU01176011.1/665-604
CUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGCCACAGAGCCGCUCUCAAGCUAGAUAACCGAAAGU
....(.(................................................).)....
>AAKO01001629.1/14298-14360
UGCUUUGGCGCUUUAGCUGUAUGAUAGAUUUAAACUACUUCAUAAAGCUAGAUUACCAAAGCA
...........(.(...................................).)...........

ORB p-value ORB frequency
(per structure per nucleotide)
Means
ratio
1 (U()G) < 0.001 10
AF155142.1/45725-45784
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUAUUGGUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUAUUGGUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUAUUGGUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
.........1.........2.........3.........4.........5.........6
123456789012345678901234567890123456789012345678901234567890
2 (Y()G) < 0.001 8.75
AF155142.1/45725-45784
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUAUUGGUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUAUUGGUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUAUUGGUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUAUUGGUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUAUUGGUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUAUUGGUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
.........1.........2.........3.........4.........5.........6
123456789012345678901234567890123456789012345678901234567890
3 (A()U) < 0.001 7.37
AF155142.1/45725-45784
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUAUUGGUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUAUUGGUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUAUUGGUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUAUUGGUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
.........1.........2.........3.........4.........5.........6
123456789012345678901234567890123456789012345678901234567890
4 (G()A) < 0.001 10.1
AF155142.1/45725-45784
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUAUUGGUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
.........1.........2.........3.........4.........5.........6
123456789012345678901234567890123456789012345678901234567890
5 (.GU.().NN.) < 0.001 17
AF155142.1/45725-45784
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUAUUGGUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUAUUGGUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUAUUGGUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUAUUGGUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUAUUGGUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUAUUGGUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUAUUGGUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUAUUGGUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUAUUGGUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUAUUGGUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
.........1.........2.........3.........4.........5.........6
123456789012345678901234567890123456789012345678901234567890
6 (.N.) < 0.001 1.81
AF155142.1/45725-45784
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUAUUGGUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUAUUGGUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUAUUGGUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUAUUGGUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUAUUGGUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUAUUGGUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUAUUGGUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUAUUGGUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUAUUGGUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUAUUGGUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUAUUGGUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUAUUGGUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUAUUGGUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUAUUGGUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUAUUGGUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUAUUGGUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUAUUGGUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUAUUGGUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUAUUGGUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUAUUGGUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUAUUGGUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUAUUGGUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUAUUGGUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUAUUGGUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUAUUGGUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUAUUGGUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUAUUGGUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUAUUGGUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUAUUGGUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
.........1.........2.........3.........4.........5.........6
123456789012345678901234567890123456789012345678901234567890
7 ((U)C)A < 0.001 2.54
AF155142.1/45725-45784
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUAUUGGUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUAUUGGUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUAUUGGUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
.........1.........2.........3.........4.........5.........6
123456789012345678901234567890123456789012345678901234567890
8 C(U(U)) < 0.001 2.53
AF155142.1/45725-45784
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUAUUGGUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUAUUGGUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUAUUGGUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUAUUGGUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUAUUGGUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUAUUGGUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
.........1.........2.........3.........4.........5.........6
123456789012345678901234567890123456789012345678901234567890
9 C(U(A)) < 0.001 2.88
AF155142.1/45725-45784
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUAUUGGUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
.........1.........2.........3.........4.........5.........6
123456789012345678901234567890123456789012345678901234567890
10 ((A)G)C < 0.001 1.19
AF155142.1/45725-45784
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUAUUGGUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
.........1.........2.........3.........4.........5.........6
123456789012345678901234567890123456789012345678901234567890
ORB p-value ORB frequency
(per structure per nucleotide)
Means
ratio

NCM p-value NCM frequency
(per structure per nucleotide)
Means
ratio
1 (U()G) < 0.001 10
AF155142.1/45725-45784
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUAUUGGUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUAUUGGUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUAUUGGUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
.........1.........2.........3.........4.........5.........6
123456789012345678901234567890123456789012345678901234567890
2 ((A)U)A < 0.001 4.07
AF155142.1/45725-45784
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUAUUGGUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
AUCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGAGUGUAUUGGUCUUCAUAAAGCUAGAUAACCGAAAGU
.........1.........2.........3.........4.........5.........6
123456789012345678901234567890123456789012345678901234567890
NCM p-value NCM frequency
(per structure per nucleotide)
Means
ratio

Structure is visualized using R2R 1.0.6 (Zasha Weinberg).
LOGOS are generated with ggseqlogo (Omar Wagih).